学ChIP-seq生信分析,发表观研究高分文章
2019.02.26

表观遗传学研究的一个重要领域是分析蛋白质如何与DNA相互作用,并由此影响基因行使功能。这其中应用最为广泛的技术,就是基于抗体-抗原特异性结合的染色质免疫沉淀技术(ChIP)。而将ChIP与高通量测序结合的ChIP-seq,可通过一次实验对全基因组范围内特定蛋白结合的DNA序列进行分析,可谓是各种ChIP相关技术中的“万事通”,在个体发育、疾病发生、动植物育种等领域的研究中都有广泛应用。


这么重要的技术,做课题发文章自然少不了!可是,不少小伙伴千辛万苦搞定了ChIP实验,拿到测序数据却犯了难——


  • “检峰是怎么一回事,结果该如何分析?”

  • “据说可以从测序结果评估ChIP实验质量,应该看哪些指标?”

  • “分析结果不理想,增加数据量是否能改善?”

  • ……


为帮助大家解决这些疑问,更好地理解和应用ChIP-seq得到的数据,新年后安诺基因首次生物信息在线交流将在本周三进行!本次主题是和大家一起探讨ChIP-seq分析中的相关知识,着重介绍信息分析中的主要分析步骤和关键的质控点。欢迎有兴趣的老师加入在线交流群,与我们一起讨论,共同进步~


不用再眼馋别人文章里的美图了!

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—— ——本期交流—— ——

● 交流时间:2019年2月27日,15:00-16:00

● 交流主题:ChIP-seq主要分析步骤、质控标准及注意事项

● 交流内容:ChIP-seq的背景和实验原理、ChIP-seq主要分析步骤、ChIP-seq分析的质控事项 

分享内容可能有调整,获取更多干货请参与当日交流。

● 交流平台:安诺基因生物信息交流QQ1群(213357902)及2群(475638865)同步交流,(1群已满,新加入的老师请加2群)。

● 交流形式:视频/语音实时交流

● 主持人:产品经理 朱腾飞

● 主讲人:高级信息分析工程师


注:进群时请务必备注姓名及工作单位


您可以在评论里留下您感兴趣的问题,我们将对问题进行整理,在线交流的过程中主讲人和具体相应信息分析负责人将进行详细解答。


参考文献

[1] Park P J. ChIP-seq: advantages and challenges of a maturing technology[J]. Nat Rev Genet, 2009, 10(10):669-80.


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